반응형 # Computational Chemistry/About Computational Chemistry2 [C.Chem] Gaussian 16을 이용한 QM 계산의 기본 절차 지난 학기 대학원 수업에서 계산법 소개용으로 작성했던 프레젠테이션인데, 그냥 버리기는 아까워 여기에 적어볼까 한다. 사실 계산화학을 하는 사람이 대한민국에 얼마나 있는지 잘 모르기 때문에 큰 효용성이 있을지는 의문이지만.. 실험실마다 방법이 다르겠지만, 내가 속한 실험실에서의 계산 진행의 절차는 대략 다음과 같다. 1. Draw overview first. 항상 모든 계산의 시작은 '어디로부터' 시작해서 '무엇을' 위해 하는지를 생각하는 것이다. 하나의 방향성을 가지고 있지 않으면 계산 중간중간에 나타날 수많은 난관들을 극복하기가 매우 까다롭다. 간단한 overview를 논문을 읽거나 랩미팅, 저널클럽 등에서 스터디한 후 'Chemdraw'나 'Chemsketch'를 이용하여 반응의 전반적인 mechan.. 2022. 1. 14. [C.Chem] Gaussian에서 Orbital swap하기 1. Orbital 확인하기 계산을 하다 보면 전자가 원하는 오비탈에 있지 않은 경우가 있습니다. 컴퓨터는 그저 Multiplicity와 Charge에 기반하여 계산을 하기 때문에, 어느 오비탈에 전자가 있어야 하는지까지는 생각하지 않기 때문인데, 이 때문에 때때로 직접 오비탈을 변경해줘야 하는 경우가 생깁니다. Molden에서 원하는 Compound를 열어 보면 Miscellaneous 칸에 있는 Dens. Mode가 있습니다. 이 Density mode를 통하여 오비탈의 모양을 직접 볼 수 있습니다. 그러나, 일반적인 계산에서는 이 Density mode가 나오지 않습니다. 이 때문에 키워드를 조금 입력해 주어야 합니다. --- %cpu= %mem= %chk= ~~ pop=full gfinput gf.. 2021. 1. 6. 이전 1 다음 반응형
