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# Computational Chemistry11

[TIP] #1 파워포인트 제목이 대문자만 나오는 문제 파워포인트에서는 다양한 서식을 제공하는데, 이러한 서식을 가져와 쓰다 보면 가끔 영어가 대문자로만 표시되고 소문자가 표시되지 않는 문제가 있다. 만약 영어가 대문자만 나온다면.. 마우스 '우클릭' 후 '글꼴' 항목을 눌러보자. 자 그러면 다음과 같이 '모두 대문자로' 라고 표시되어 있음을 알 수가 있다. 체크박스를 해제해 준 후 '확인' 버튼을 눌러주자. 이렇게 뒤에 나오는 알파벳들이 소문자로 바뀌었음을 볼 수 있다. Edited 21.03.16 by 푸른삿포로 2022. 3. 16.
[C.Chem] Gaussian 16을 이용한 QM 계산의 기본 절차 지난 학기 대학원 수업에서 계산법 소개용으로 작성했던 프레젠테이션인데, 그냥 버리기는 아까워 여기에 적어볼까 한다. 사실 계산화학을 하는 사람이 대한민국에 얼마나 있는지 잘 모르기 때문에 큰 효용성이 있을지는 의문이지만.. 실험실마다 방법이 다르겠지만, 내가 속한 실험실에서의 계산 진행의 절차는 대략 다음과 같다. 1. Draw overview first. 항상 모든 계산의 시작은 '어디로부터' 시작해서 '무엇을' 위해 하는지를 생각하는 것이다. 하나의 방향성을 가지고 있지 않으면 계산 중간중간에 나타날 수많은 난관들을 극복하기가 매우 까다롭다. 간단한 overview를 논문을 읽거나 랩미팅, 저널클럽 등에서 스터디한 후 'Chemdraw'나 'Chemsketch'를 이용하여 반응의 전반적인 mechan.. 2022. 1. 14.
Chapter 1. 계산 모델과 계산 화학 (Computational Models & Model Chemistries) - 1 모든 화학자들은 모델을 사용한다. 화학을 처음 시작하는 학생들은 그들의 이해를 돕고, 분자 구조를 시각화하기 위하여 플라스틱 모델을 사용한다. 최근, 학생들과 숙련된 연구자들은 같은 목적을 위하여 화학 구조를 그리는 프로그램을 사용하기 시작하였다. 모든 모델이 물리적이거나 그림으로 된 물체는 아니다. 예를 들어, SN2 메커니즘은 많은 화학 반응들을 성공적으로 설명하는 특정한 수준의 단순한 모델이 된다. 이러한 모든 것들은 공통적으로 실제 화학적 물질들과 과정들을 근사하기 위해 미리 정의된 일련의 물체(object)들인 것이다. 유사한 방법으로, 계산화학(Computational Chemistry)은 물리학의 기본 법칙들을 기반으로 하여 화학 구조와 반응들을 수치화하여 예측한다. 이러한 것들은 화학자들로.. 2021. 4. 9.
[C.Chem] Gaussian에서 Orbital swap하기 1. Orbital 확인하기 계산을 하다 보면 전자가 원하는 오비탈에 있지 않은 경우가 있습니다. 컴퓨터는 그저 Multiplicity와 Charge에 기반하여 계산을 하기 때문에, 어느 오비탈에 전자가 있어야 하는지까지는 생각하지 않기 때문인데, 이 때문에 때때로 직접 오비탈을 변경해줘야 하는 경우가 생깁니다. Molden에서 원하는 Compound를 열어 보면 Miscellaneous 칸에 있는 Dens. Mode가 있습니다. 이 Density mode를 통하여 오비탈의 모양을 직접 볼 수 있습니다. 그러나, 일반적인 계산에서는 이 Density mode가 나오지 않습니다. 이 때문에 키워드를 조금 입력해 주어야 합니다. --- %cpu= %mem= %chk= ~~ pop=full gfinput gf.. 2021. 1. 6.
[Contents] Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods 2nd. Edition - James B. Foresman의 'Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods' 2판의 목차입니다. - Gaussian을 활용한 계산법에 대한 책이 국내에는 많이 있지 않고, 또 배울 수 있는 기회 역시 부족하여 어딘가에 정리를 해 놓으면 좋겠다는 취지에서 시작하였습니다. - 문장은 한글로 기술하되, 주요 단어들은 영어로 기술할 예정입니다. 직접 배우며 느낀 점 중 하나가 한글로 된 단어를 잘 사용하지 않는다는 점이었기 때문에.. 아무튼 그렇습니다. - 가능한 정확히 번역하려 노력하였으며, 가독성을 위한 변형이 있을 수 있습니다. 유의해 주시면 감사하겠습니다. Part 1. 필수 개념과 기술 Chapter 1. Computational 모델 & 모.. 2020. 12. 3.
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