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계산화학3

[L] #2. cd 두 번째 명령어는 cd이다. Linux에서는 terminal을 이용하여 모든 명령을 처리하므로, 원하는 디렉토리로 이동하기 위해서는 명령어를 입력해주어야 한다. 이를 해주는 command가 바로 cd이다.먼저 내가 위치한 경로를 파악하는 command부터 학습해 보자. 이건 간단해서 따로 포스팅을 분리하지 않았다.pwd이렇게 입력을 해 보면,다음과 같이 나온다. 즉, pwd는 현재 내가 위치한 장소를 알려주는 기능을 가진 command이다. 정확한 용어로는 path를 알려주는 기능을 가진 셈이다.자 그런데, 이동을 하고 싶다면 어떻게 해야 할까? 이 때 사용하는 기능이 바로 cd이다.cd의 기본적인 기능들을 chat gpt에게 물어봤다. 그 결과는 다음과 같다.자 하나씩 살펴보자. 자주 사용하는 몇 가지.. 2024. 3. 26.
[C.Chem] Gaussian 16을 이용한 QM 계산의 기본 절차 지난 학기 대학원 수업에서 계산법 소개용으로 작성했던 프레젠테이션인데, 그냥 버리기는 아까워 여기에 적어볼까 한다. 사실 계산화학을 하는 사람이 대한민국에 얼마나 있는지 잘 모르기 때문에 큰 효용성이 있을지는 의문이지만.. 실험실마다 방법이 다르겠지만, 내가 속한 실험실에서의 계산 진행의 절차는 대략 다음과 같다. 1. Draw overview first. 항상 모든 계산의 시작은 '어디로부터' 시작해서 '무엇을' 위해 하는지를 생각하는 것이다. 하나의 방향성을 가지고 있지 않으면 계산 중간중간에 나타날 수많은 난관들을 극복하기가 매우 까다롭다. 간단한 overview를 논문을 읽거나 랩미팅, 저널클럽 등에서 스터디한 후 'Chemdraw'나 'Chemsketch'를 이용하여 반응의 전반적인 mechan.. 2022. 1. 14.
Chapter 1. 계산 모델과 계산 화학 (Computational Models & Model Chemistries) - 1 모든 화학자들은 모델을 사용한다. 화학을 처음 시작하는 학생들은 그들의 이해를 돕고, 분자 구조를 시각화하기 위하여 플라스틱 모델을 사용한다. 최근, 학생들과 숙련된 연구자들은 같은 목적을 위하여 화학 구조를 그리는 프로그램을 사용하기 시작하였다. 모든 모델이 물리적이거나 그림으로 된 물체는 아니다. 예를 들어, SN2 메커니즘은 많은 화학 반응들을 성공적으로 설명하는 특정한 수준의 단순한 모델이 된다. 이러한 모든 것들은 공통적으로 실제 화학적 물질들과 과정들을 근사하기 위해 미리 정의된 일련의 물체(object)들인 것이다. 유사한 방법으로, 계산화학(Computational Chemistry)은 물리학의 기본 법칙들을 기반으로 하여 화학 구조와 반응들을 수치화하여 예측한다. 이러한 것들은 화학자들로.. 2021. 4. 9.
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